В далеком городе Канзас жила обычная девочка по имени Элли, чья жизнь круто изменилась в один миг, когда злая колдунья Гингема, стремясь уничтожить всех людей, наслала на город страшный ураган. Мощный вихрь подхватил домик, в котором находилась Элли вместе с верным пёсиком Тотошкой, и унес его далеко за радугу, в неведомую волшебную страну. Очнувшись после долгого полета, девочка обнаружила, что оказалась в удивительном мире, населенном маленькими забавными человечками – жевунами, которые рассказали ей, что ее домик случайно приземлился на злую волшебницу Гингему, тем самым освободив их народ от многолетнего гнета. Однако радость жевунов была омрачена печальной новостью – теперь злая сестра погибшей колдуньи, Бастинда, жаждет мести и хочет заполучить серебряные башмачки, которые перешли к Элли. Единственной надеждой девочки на возвращение домой становится великий волшебник Гудвин, который, по словам жевунов, живет в далеком Изумрудном городе и обладает силой исполнить любое желание.
Надев волшебные башмачки, Элли вместе с Тотошкой отправляется по желтой кирпичной дороге, которая, как ей сказали, ведет прямо к волшебнику. Вскоре к ней присоединяются необычные спутники, каждый из которых надеется, что Гудвин поможет им осуществить заветные мечты. Первым появляется Страшила, набитый соломой, но мечтающий получить мозги и стать умным; затем встречается Железный Дровосек, который ищет у волшебника сердце, чтобы снова чувствовать любовь и радость; а позже к компании примыкает Трусливый Лев, отчаянно нуждающийся в храбрости. Вместе они преодолевают множество опасностей и препятствий: пересекают коварные маковые поля, где аромат цветов усыпляет путников, сражаются с саблезубыми тиграми и другими чудовищами, а также сталкиваются с кознями Бастинды, которая пытается любыми способами остановить их. Добравшись наконец до сияющего Изумрудного города, путники с удивлением узнают, что могущественный Гудвин согласится помочь им лишь при одном условии – они должны уничтожить злую волшебницу Бастинду, что становится их самой сложной и опасной миссией, требующей от каждого проявить именно те качества, которых им так не хватает.